La funcionalidad de backup no replica el borrado de notas, manteniendo archivos en la nube que ya no son vigentes.
Toca eliminar toda la información del backup en la nube, y lanzar el proceso del backup manualmente, o esperar que se se ejecute de forma programada, para obtener una réplica exacta de la estructura actualizada en el dispositivo.

Sería muy útil si el backup no sólo actualizase ficheros editados o nuevos, sino también los eliminados.